2020-04-01から1ヶ月間の記事一覧

MetaMapの使い方: 医療文書からUMLS conceptを抽出するには

1. 目的 ここで取り上げるのは医学論文, 診療記録, 退院サマリーなどの医療文書に対して固有表現抽出を行うMetaMapという医療言語処理ツールです. このツールを使うと任意の医療文書から疾患名, 薬剤名, 治療名などを抽出することができます. 一見, ただ目的…

MIMIC-CXRから読影レポートとjpg画像だけを取得する

はじめに 胸部単純X線の画像と読影レポートの公開データセットMIMIC-CXRを利用するための準備をしてみます。 MIMIC-CXRは次の2つの形式で公開されています: (1) MIMIC-CXR. DICOM形式の画像と, 読影レポートのtxtファイルが提供されている. physionet.org (2…